Gjerstad frikirke er tilsluttet Den evangelisk-lutherske frikirke.
Bygget ble oppført som bedehus for Indremisjonsforeningen i 1876 og har blitt brukt av Frikirken siden 1887. Det ble ombygget i 1934, 1966 og 1984–87. Menigheten ble ifølge eget nettsted formelt stiftet i 1889 av medlemmer av Risør frikirke som var bosatt i Gjerstad-området. Den sies å ha 136 medlemmer.