Sælen menighet ble utskilt fra Fyllingsdalen ved nyttår 1982. Det var en begrenset arkitektkonkurranse i 1998, og kirken ble tegnet av Lille Frøen arkitekter ved Nikolai Alfsen, som vant med et prosjekt kalt «Portal». Kirken ble vigslet den 2. desember 2001.
Sælen kirke er en arbeidskirke med lys tegl fra Finland i fasaden. Bygningskroppen er sammensatt. Selve kirkedelen er den høyeste delen av bygget og har et 28 meter høyt tårn, mens lavere bygningsdeler inneholder rom for andre aktiviteter. Kirken har 450 sitteplasser og rager over omgivelsene der den står på et høydedrag. Utearealene er formgitt av landskapsarkitekt Svein Erik Bergem.
Selve kirkerommet har langkirkeform med et sideskip med galleri på sørsiden samt orgelgalleri i vest. Rommet er utsmykket av Søren Ubisch. Alterveggen skal være et symbol på himmelen eller universet, og den visuelle effekten besørges av steinsettingen, med en veksling mellom glaserte koppstein og innsatte glassprismer. Også alter, prekestol og døpefont er av stein, nærmere bestemt norsk granitt med veksling mellom slipte og uslipte flater. På alterfronten mot menigheten er et kristusikon. En helligåndsdue over døpefonten er av krystaller som bryter lyset i forskjellige farger. Orgelet på vestgalleriet er bygget av tyske Glatter-Götz og har 22 stemmer. Kirken sies å ha god akustikk, og er populær som konsertkirke.
På kirketorget utenfor henger et billedteppe laget av Anna Bolstad. Klokkene i tårnet er støpt av Olsen Nauen.
Det er ikke kirkegård på stedet, men Fyllingsdalen gravplass er bare et par kilometer unna.
Kilder og videre lesning: